法律分析：小的民事纠纷赔偿不会留下案底。民事纠纷的主体之间法律地位平等，其内容是对民事权利义务的争议，同时，民事纠纷具有可处分性，故民事纠纷不会留下案底。民事纠纷由法院负责管辖并裁决，法院会对民事纠纷案件存档。所以在民事纠纷案件中，法院会有案件记录。但案件记录只是法院的案件档案，不是行政处罚案底也不是刑事犯罪案底。
法律依据：《中华人民共和国民事诉讼法》第一百五十二条 判决书应当写明判决结果和作出该判决的理由。判决书内容包括：（一）案由、诉讼请求、争议的事实和理由；（二）判决认定的事实和理由、适用的法律和理由；（三）判决结果和诉讼费用的负担；（四）上诉期间和上诉的法院。判决书由审判人员、书记员署名，加盖人民法院印章。