历年医保余额不会自动清零，余额将会累计至下一年度。但是需要注意的是，医疗保险有有效期限，过期未使用的医保资金将被收回。
根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，医疗保险的基本原则之一就是保证参保人的合法权益。因此，历年医保余额不会自动清零，余额将会累计至下一年度。但是需要注意的是，医疗保险有有效期限，过期未使用的医保资金将被收回，需要广大参保人员提前规划好医疗消费计划，尽量避免浪费医保资金。
如何查询医保余额？可以通过以下方式查询医保余额1. 到所在地社保机构窗口或网站上查询；2. 使用支付宝、微信等移动支付软件进行查询；3. 拨打当地的社会保障咨询电话进行查询等。
历年医保余额不会自动清零，但是需要注意医疗保险的有效期限。建议广大参保人员提前规划好医疗消费计划，尽量避免浪费医保资金，并通过多种方式查询自己的医保余额，及时了解自己的权益情况。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第二十二条 个人账户内的医疗保险费用余额，不退还本人，亦不转为其他用途，留存到下一年度使用。