法律分析：不合法，可以先与公司协商，处理不成可以直接到当地法院起诉公司。旷工一天扣三天工资，属于克扣工资的行为，侵犯了劳动者获得劳动报酬的权利，严重违反了公平原则。法院对“旷工一天，扣三天工资”的态度基本上是不支持。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》 第二十六条 下列劳动合同无效或者部分无效：（一）以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的；（二）用人单位免除自己的法定责任、排除劳动者权利的；（三）违反法律、行政法规强制性规定的。对劳动合同的无效或者部分无效有争议的，由劳动争议仲裁机构或者人民法院确认。