灰指甲是由真菌感染所致，发病原因多由于真菌性甲沟炎、脚气、癣病感染引发，因造成灰指甲（灰趾甲）的真菌藏匿在指甲内，容易反复发作，治疗时较困难。
1、长期穿高跟鞋的人：穿上高跟鞋或小码的鞋后，脚部前掌受力增大，五指相互挤压，容易造成局部血液循环不佳、指甲变形及甲剥离。
2、免疫功能低下的人：老年人、孕妇及糖尿病人甲真菌病的发病率高。灰指甲病人大多数先有其他部位的真菌感染，这是致病菌的主要来源。
3、经常做美甲、修甲的人：美甲过程中，使用的很多的化学物质会让指甲愈来愈脆弱，剪、磨等动作都有可能造成甲损伤，造成真菌的间接感染，引起灰指甲。
4、家庭主妇、厨师及某些工人：这类人群长期与水或各种化学物质接触，导致甲板浸渍、腐蚀，改变了甲板表面的酸碱度和防御能力，会使真菌更容易侵入。
养成良好的卫生习惯，平时勤洗脚、勤换袜，鞋袜经常曝晒，保持干燥。增强机体抵抗致病真菌的能力，如加强体育锻炼，注重营养，对于提高预防灰指甲都是有利的。