法律分析：根据保险合同的约定，保险公司在赔偿重大疾病时会有免赔额的规定。对于染色体疾病，保险公司是否会取消免赔额，应根据具体保险合同条款来确定。
法律依据：
1.《保险法》第六十二条规定：保险合同应当采取标准化条款。标准化条款的内容应当公平合理，符合保险业务实际和保险合同的需要。
2.《保险法》第六十七条规定：保险合同应当载明保险责任和免除或者限制保险人责任的条款。
3.《重大疾病保险条款》第五条规定：被保险人首次确诊患有本合同所列明的重大疾病，保险人应当按照合同约定给付保险金。合同对于染色体疾病的定义和赔偿标准应当在条款中明确规定。
综合上述法律依据，如果保险合同中明确规定染色体疾病属于免赔额范围内，保险公司就可以取消免赔额。因此，被保险人在购买重疾险时应当认真阅读合同条款，以免遇到纠纷。
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