法律分析：
保险公司以基因突变为由拒绝理赔，是否存在违约行为，需要根据具体情况来判断。如果保险合同中没有明确规定基因突变为免责事由，保险公司拒绝赔偿属于违约行为。但如果合同中存在基因突变为免责事由的约定，保险公司则不承担赔偿责任。
法律依据：
1.《保险法》第九十一条规定：“保险公司应当按照合同约定承担赔偿责任。”
2.《保险法》第十七条规定：“保险合同一经订立，对双方当事人具有法律约束力。”
3.《合同法》第十四条规定：“当事人应当遵循诚实信用原则，履行自己的义务，保护对方当事人的合法权益。”
4.《合同法》第二十七条规定：“合同一方未履行义务或者履行义务不符合约定的，应当承担违约责任。”
综上所述，保险公司应当按照合同约定承担赔偿责任，如果保险合同中没有约定基因突变为免责事由，保险公司拒绝赔偿属于违约行为。因此，保险合同的约定是判断保险公司是否存在违约行为的关键。