法律分析：农村合作医疗的报销一定要在工作日进行，周六周日的话是不能进行的，因为周六周日所有的工作人员都是休息的状态，计算机，也是出现一个关闭状态，是不能报销的。
法律依据：《中华人民共和国民法典》
第二十八条 符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。
第二十九条 参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。 社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。
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