宅基地纠纷一般是到乡政府或者县政府进行处理：1、如果是单位跟单位之间的纠纷，要县级人民以上人民政府处理；2、个人之间或者个人与单位之间，由乡级人民政府或者县级以上处理；3、如果相关政府部门没有处理好，双方对处理结果不服的，可以准备好相关材料，向当地的人民法院起诉，通过司法途径解决。
【本文关联的相关法律依据】
《土地管理法》第16条第2款规定：”个人之间，个人与单位之间争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。“《土地管理法》第16条第3款规定：”当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以在接到处理决定通知之日起30日内，向人民法院起诉。”
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