甲方拖欠清包工工程款时，可以向法院起诉，申请支付令或者申请强制执行。
以免超过诉讼时效，会对债权人产生不利的影响，法律规定的诉讼时效为两年。对方在法院判决后仍不执行法院判决的，另一方可以申请法院强制执行。法院在受理强制执行时，会依法查询债务人名下的房产、车辆、证券和存款。有能力而拒不执行的情况下，则涉嫌拒不执行判决、裁定罪。
发生法律效力的民事判决、裁定，以及刑事判决、裁定中的财产部分，由第一审人民法院或者与第一审人民法院同级的被执行的财产所在地人民法院执行。相关规定由人民法院执行的其他法律文书，由被执行人住所地或者被执行的财产所在地人民法院执行。
受害人可以向有管辖权的人民法院提起诉讼，因建设工程施工合同发生纠纷的，应当向建设工程所在地的人民法院提起诉讼。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》
第八百零七条
发包人未按照约定支付价款的，承包人可以催告发包人在合理期限内支付价款。发包人逾期不支付的，除根据建设工程的性质不宜折价、拍卖外，承包人可以与发包人协议将该工程折价，也可以请求人民法院将该工程依法拍卖。建设工程的价款就该工程折价或者拍卖的价款优先受偿。
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