单细胞基因个性化作图之气泡图

来源：飒榕旅游知识分享网

前面说过了小提琴图的绘制（）。这里继续说单细胞基因可视化的方法---气泡图，这是最受欢迎的一种展示基因表达的图了，但凡是单细胞的文章都会出现。这里我们提供的方法不仅仅局限于单细胞数据，其他的数据也可以用来做气泡热图。

Seurat包自带做气泡图的函数DotPlot，可以通过ggplot修饰，对图形的外形，颜色等修改，具体操作如下。

marker <- c("ACKR1","RAMP2",
            "LUM","COL3A1",
            "KRT14","KRT5",
            "CD69","CD52")
DotPlot(scedata, features = marker)+coord_flip()+
  theme_bw()+
  theme(panel.grid = element_blank(), axis.text.x=element_text(hjust = 1,vjust=0.5))+
  labs(x=NULL,y=NULL)+guides(size=guide_legend(order=3))+
  scale_color_gradientn(values = seq(0,1,0.2),colours = c('#330066','#336699','#66CC66','#FFCC33'))

以上是最普通的作图，其他文章中还出现过更加高级的做法，例如这样的：

这样的：

还有这样的：

这里我们提供三种方法绘制单细胞基因表达气泡图，每种图形都可以经过尝试变化，形成新的图形，也可以展示不一样的东西！

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