完成单细胞定群后，就可以做很多东西了，首先可视化marker基因，这是很多单细胞文章中不可或缺的一部分，当然，marker基因的可视化可以拓展到对任意自己感兴趣基因的可视化。
小提琴图是其中的一种。Seurat自带函数VlnPlot可以进行基因可视化，其实在前面QC结果的战事中已经使用过一次了。
VlnPlot(scedata,
features = c("RAMP2","VWF","PECAM1","LUM"),
pt.size = 0,
ncol = 2)
通过添加split.by参数，VlnPlot可以显示基因在各个样本中的表达情况。
VlnPlot(scedata,
features = c("RAMP2","VWF","PECAM1","LUM"),
pt.size = 0,
ncol = 2,
split.by = "orig.ident")
但是，VlnPlot有一个问题就是，只能展示单个图，不能批量展示基因的表达。不能实现很多文章中出现堆叠的效果。这就需要额外的修饰改造达到这种效果。这里我们提供两种方法可以近似获得堆叠小提琴图效果（图A，B），但细节问题还需进一步修饰。
更多精彩请关注---《KS科研分享与服务》
因篇幅问题不能全部显示，请点此查看更多更全内容